许东的「AI生命科学」进化史:从90年代泡沫繁荣,到深度学习复兴( 七 )
把许东招进来的 , 正是担任蛋白质折叠项目组长的徐鹰 。
彼时 , 徐鹰刚刚从橡树岭的数学与计算机科学部转到生命科学部 。 他们一拍即合 , 徐鹰偏数学计算背景 , 许东偏生物物理背景 , 而橡树岭的另一位研究员——俄国数学家VictorOlman博士 , 则具备统计学背景 。
1997年 , 他们组成了橡树岭的“三剑客” , 在此后的6年时间里合作了40多篇论文 , 在蛋白质结构预测领域打出了名堂 。

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许东、徐鹰2001年在R&D100的领奖仪式上
那段时间里 , 许东和徐鹰还一起做出了那个时代中最好的蛋白三维结构预测工具——Prospect , 在人类基因组测序中刻下了重要一笔 。 2001年 , 两人以此拿下R&D100奖 , 在新世纪初拿下开头彩 。
橡树岭实验室坐落在山沟沟里 , 偏僻冷清却环境优美 , 是个安心做学问的好地方 。 “在那里 , 收获的不仅仅是科研论文 , 更是一种经历 , 对国家实验室如何运作 , 科研水平有了更深入的了解 。 实验室提倡科研合作 , 也逐渐学会与他人相处、共同进步 。 ”
2003年实验室改组后 , 限于经费问题 , 原生命科学部大部分人去了工业界 , 许东和其他人也各自踏上了教职之路 。
当最年轻的系主任遇上深度学习许东一行人是幸运的 , 这群从橡树岭出来的人在美国高校大受欢迎 。
新世纪初 , 几乎所有高校都在建设生物信息研究所 , 徐鹰最终去到佐治亚大学 , 成为了该校生信研究所的首任所长 , 并拉去了VictorOlman , 两人继续共事 。 许东则去了密苏里大学的哥伦比亚分校(UniversityofMissouri , Columbia , 下称“密大”) 。
2003年8月 , 许东以计算机科学系副教授、JamesC.Dowell讲座副教授 , 以及ChristopherS.Bond生命科学中心研究员的身份 , 被正式引进到该校 。
而他将在这个被称为“哥村”的地方 , 一待近二十年 。
2007年底 , 42岁的许东担任该校计算机科学系的系主任 , 成为了密大所有系主任中最年轻的一位 。 这是许东人生中的一个重要时刻 , 也是在美国高校管理人员中为数不多的华人面孔 。

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2007年 , 许东任职系主任时留影在这个非母语环境中 , 许东不善言辞 , 但这次任职 , 却收获了全院的支持 。
许东说到 , “如果要说我有什么合适的地方 , 或许是我学问做得还不错 , 文章比较多 , 更重要的是 , 大家觉得我不会借机给自己谋什么福利 。 ”
上任第一件事 , 就是设计课程 。 许东在橡树岭这所千人实验室的经历派上了用场 。 他考虑了系内近20名教授的专长 , 准备将研究方向集中于三个领域 , 分别为网络、多媒体、生物信息 。 许东认为 , 计算机学科领域太广 , 必须专精才能突出 。
”当时的密大计算机系有50名博士生 , 人力资源丰富 , 如果善加整合 , 提供明确研究方向 , 必能协助教授 , 做出量多质佳的研究 , 提高计算机系的整体素质 。 ”
许东将学术机构则比作私人企业 , 学术合作的关键在于最后的产值 , 而系主任就是拉拉队鼓舞士气 , 让团队有最好表现 。
那些年里 , 许东也长期奔走在国内高校 , 一边做学术讲座 , 一边推动国内大学与密苏里大学3+2、2+2等联合培养项目 。
许东回忆 , 他跑遍了中国几十所双一流高校 , 回国次数不计其数 。 特别是吉林大学 , 他每年都去讲学 , 并担任过大约十年的唐敖庆客座教授 , 和许多的老师同学建立了深厚的友谊 , 合作发了几十篇论文 。 比如 , 时任吉林大学计算机学院副院长的梁艳春教授 , 也有十年每年到密苏里大学许东的实验室访问、合作 。
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